Подписаться на новости
  • Сенатор
  • ООО "Ай Вао"
  • Биомолтекст2020
  • vsh25
  • Vitacoin

Чем лечить нейробластому?

Уровень экспрессии пары генов определит необходимость назначения антительных лекарств от рака

XX2 век по материалам пресс-службы МФТИ.

Биоинформатики из МФТИ совместно с коллегами из Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Сеченовского университета, Института биомедицинской химии имени В. Н. Ореховича, НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачёва, центра «Сколково» и биомедицинских компаний Omicsway, «Онкобокс» и Real Target разработали способ определения молекулы ганглиозида GD2, которая активно производится в раковых клетках и служит терапевтической мишенью. Результат исследования может повысить эффективность терапии рака GD2-специфичными антителами.

Статья Sorokin et al. RNA Sequencing-Based Identification of Ganglioside GD2-Positive Cancer Phenotype опубликована в журнале Biomedicines.

Ганглиозид GD2 – сложная небелковая молекула, присутствующая в большом количестве на поверхности многих раковых клеток. Так как здоровые клетки производят его в очень ограниченных количествах, GD2 хорошо подходит для направленной иммунотерапии. Применение моноклональных антител, специфично связывающихся с этим веществом, вошло в клиническую практику для лечения некоторых видов рака.

Содержание GD2 на поверхности клеток определяет эффективность такой иммунотерапии, поэтому важно научиться надёжно определять эту молекулу в опухолевых тканях. Классический метод иммуногистохимии часто приводит к неверным результатам из-за сложности измерений непосредственно в образцах фиксированных тканей, которые получаются при биопсии. Анализ данных РНК-секвенирования оказывается удобнее и точнее, поэтому биоинформатики взялись за поиск связи между содержанием ганглиозида GD2 и работой маркерных генов.

Так как GD2 производится в результате ряда последовательных биохимических реакций, его содержание зависит от баланса участвующих в процессах ферментов. На активность последних влияет уровень экспрессии кодирующих их генов. То есть, по уровням экспрессии этих генов можно классифицировать биологические образцы на основании содержания в них GD2 – определить их GD2-фенотип.

Чтобы понять, какие гены в наибольшей степени связаны с GD2-фенотипом, учёные сравнили уровни экспрессии генов, вовлечённых в биохимический путь синтеза ганглиозидов. В анализ также добавили пару из двух «ближайших» ферментов – катализаторов синтеза самого GD2 и его непосредственного предшественника. Учёные выяснили, что именно по экспрессии этих двух генов (ST8SIA1 и B4GALNT1) можно наиболее точно предсказать GD2-фенотип клетки. Эта пара оказалась лучшим биомаркером, чем любая другая или гены по отдельности. Таким образом, посчитав количественный уровень экспрессии двух генов в клетках больного, можно сделать вывод о применимости GD2-направленной терапии. Результат исследования может применяться для многих типов рака и позволит повысить эффективность терапии GD2-специфичными антителами.

«Стоимость курса лечения GD2-специфичными антителами может составлять сотни тысяч долларов, а помогает оно при нейробластоме где-то в четверти случаев, причем часто имеет очень сильные побочные эффекты. Получается, что для большинства пациентов такая терапия оказывается бесполезна, даже вредна, не говоря о затратах. Чтобы избежать этого, надо внедрять новые молекулярно-диагностические подходы. В этом и заключается задача нашей лаборатории», – комментирует Антон Буздин, руководитель исследования и заведующий лабораторией трансляционной геномной биоинформатики МФТИ.

Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований.

Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru


Читать статьи по темам:

лечение рака персонализированная медицина экспрессия генов Версия для печати
Ошибка в тексте?
Выдели ее и нажми ctrl + enter
назад

Читать также:

Оценить эффективность

Ученые разработали способ индивидуального подбора терапии рака желудка на основе данных секвенирования РНК опухолевых клеток.

читать

Радиотерапия по генетическим показаниям

Различные варианты нескольких генов позволяют предсказать, будет ли радиотерапия эффективной в лечении рака или, наоборот, приведет к ухудшению.

читать

Для каждой опухоли – персональные препараты

Определение функционального профиля (набора «работающих» генов) конкретной опухоли в перспективе позволит проводить персонализированную терапию больных раком пациентов.

читать

Вам с липосомами или без?

Создан тест на восприимчивость к противораковым препаратам, который поможет пациентам сэкономить время и деньги.

читать

Вакцина от рака поджелудочной железы

Метод создания персонализированных вакцин, которые смогут задержать развитие рака поджелудочной железы.

читать

Убивать, но не всех

Сохранение в опухоли клеток, наиболее чувствительных к терапии, позволит избежать устойчивости и снизить токсичность для пациента за счет уменьшения дозы.

читать