Подписаться на новости
  • Сенатор
  • ООО "Ай Вао"
  • RUSSIAN TECH WEEK
  • Vitacoin

Персональная геномная машина: секвенатор ДНК размером с принтер

В продажу поступает настольный расшифровщик генома
Мембрана по материалам Gizmag: Printer-sized Personal Genome Machine launched

Аппарат весит 22 килограмма и не займёт много места в лаборатории, – расхваливают своё изобретение американцы (фото Ion Torrent). Размер и вес, как у большого принтера, а возможности – как у целой лаборатории. Новый аппарат впервые непосредственно переводит генетическую информацию в цифровой вид, минуя множество промежуточных шагов.

Теперь расшифровка генома какой-нибудь бактерии обойдётся учёным дешевле, чем с предыдущими методами, да ещё и займёт не дни или недели, а только пару часов. «Персональную геномную машину» (Personal Genome Machine) создала американская компания Ion Torrent.

В основе новинки лежит полупроводниковый чип, который в реальном времени измеряет концентрацию ионов водорода, производимых в ходе репликации ДНК.

Разумеется, перед отправкой образца на анализ его нужно заранее подготовить, для чего служит набор реактивов, поставляемых вместе с машиной и докупаемых по мере необходимости.

Сердце всей системы – ионный полупроводниковый секвенирующий чип (Ion Semiconductor Sequencing Chip). Упрощённо он работает так: 1,3 миллиона его микроскопических углублений заполнены уникальными шаблонами ДНК-последовательностей. Когда микронасосы прогоняют подготовленный образец генетического кода через чип, ферменты начинают достраивать цепи ДНК, подключая соответствующие нуклеотиды. При этом освобождаются ионы водорода, которые попадают в чувствительный слой чипа и фиксируются высокочувствительными датчиками под его поверхностью. В результате рождается карта генома в виде набора «ионных сигналов» (иллюстрации Ion Torrent).

После того как машина записала последовательность ионных сигналов, та переправляется на сервер, который по оригинальному алгоритму конвертирует эту информацию в последовательность пар оснований и возвращает её в виде файла, пригодного для дальнейшего анализа рядом доступных программ.

Вопреки названию «персональная геномная машина» не предназначена для медицинской диагностики по ДНК людей или терапевтических целей. Её рынок (во всяком случае пока) – научно-исследовательские организации.

Компания Life Technologies, известная своими собственными технологиями секвенирования ДНК, минувшим летом купила Ion Torrent, расширив тем самым спектр предлагаемого биотехнологического оборудования. Life Technologies сообщает, что Personal Genome Machine стоит около $100 тысяч.

Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru
22.12.2010

Читать статьи по темам:

анализ ДНК секвенирование генома Версия для печати
Ошибка в тексте?
Выдели ее и нажми ctrl + enter
назад

Читать также:

Секвенирование ДНК с помощью нанопор: еще быстрее и дешевле

Система из нанопор может существенно ускорить анализ генома, позволяя непосредственно анализировать цепи ДНК из десятков тысяч и более пар оснований, а не восстанавливать их структуру по фрагментам коротких отрезков.

читать

Прорыв в секвенировании: ДНК-судоку

Современные технологии секвенирования ДНК позволяют работать одновременно с десятком образцов. Метод ДНК-судоку позволит секвенировать сотни тысяч последовательностей ДНК одновременно.

читать

Бородатое мамо, или 30 лет спустя

Парень из Канзаса, выросший в детдоме и у приёмных родителей, решил найти свою мамочку. И нашел... слабонервным читать не рекомендуется!

читать

Круг подозреваемых размером с биочип

При анализе ДНК с помощью нового биочипа вероятность случайного совпадения генотипов составляет 0,4%. Такая вероятность слишком велика для доказательства причастности к преступлению, но позволяет сузить круг подозреваемых.

читать

Тридцатидолларовый геном?

Новая технология секвенирования ДНК, по мнению разработчиков микрожидкостного чипа, позволит прочитать персональный геном, израсходовав реактивов всего на 30 доллаов

читать

Секвенирование генома: вам ДНК целиком или нарезать?

Разработка метода, позволяющего при секвенировании генома читать последовательность нуклеотидов целой молекулы ДНК, а не нарезанной на фрагменты, может вскоре сделать прочтение индивидуального генома рутинной процедурой.

читать