Подписаться на новости
  • Сенатор
  • ООО "Ай Вао"
  • RUSSIAN TECH WEEK
  • Vitacoin

Выбор сервиса для облачной геномики

Фармкомпаниям предложили выбрать между Google и Amazon

Софья Лопаева, Vademecum

Научно-исследовательские институты и фармкомпании должны будут выбрать между двумя «облачными» сервисами хранения данных о человеческом геноме – Google Genomics и Amazon Web Services. Amazon.com Inc и Google Inc поборются за хранение данных о геноме человека в «облаке». С помощью облачных технологий компании хотят помочь ученым в новых открытиях.

Объем мирового рынка «облачной геномики» составляет $100–300 млн и к 2018 году вырастет до $1 млрд. Предполагается, что победитель займет значительную долю этого рынка.

Эксперты предрекают успех подобным проектам, которые могут стать толчком к развитию персонализированного лечения на основе «генетического паспорта» пациента. Индивидуальный подход к терапии предполагает хранение огромного количества данных, на основе которых можно сделать вывод об эффективности лечения для определенных ДНК-профилей.

Как сообщает Reuters (Amazon, Google race to get your DNA into the cloud), помимо хранения данных ИТ-гиганты предлагают фармкомпаниям и исследовательским центрам «облачную» аналитику, которая позволит ученым разобраться в имеющихся данных о ДНК. Microsoft Corp и International Business Machines тоже хотят занять часть этого рынка.

Сейчас серверы Google и Amazon хранят информацию о геноме бесплатно. По сведениям некоторых аналитиков и ученых и заявлениям самих компаний, объем хранилища Amazon Web Services может быть больше.

У Amazon и Google уже есть крупные клиенты, пользующиеся сервисами «облачной геномики». Например, международное государственно-частное партнерство «1 000 геномов», занимающееся изучением генетической вариативности, пользуется базами Amazon и Google на безвозмездной основе. Regeneron Pharmaceuticals Inc и Geisinger Health Systems из Пенсильвании сотрудничают с Amazon, которая предоставила им хранилище для данных о геноме 250 тысяч человек. Amazon сотрудничает с благотворительной организацией Multiple Myeloma Foundation, которая занимается изучением множественной миеломы. Проект подразумевает получение полных последовательностей генома и прочих данных от тысячи пациентов для создания новых лекарств от этого заболевания. Amazon принимает участие в аналогичном проекте, посвященном болезни Альцгеймера, которым руководят Национальный институт изучения старения США (NIA) и Национальный научно-исследовательский институт генома человека (NHGRI).

Google, в свою очередь, выиграл грант фонда Autism Speaks на сбор и анализ геномов 10 тысяч детей-аутистов и их родителей, что позволит узнать генетические предпосылки развития этого заболевания. Другой клиент интернет-гиганта – компания Tute Genomics с базой, насчитывающей 8,5 млрд генетических вариаций.

Amazon берет за хранение одного полного генома человека $4-5 в месяц, а Google – $3-5. Компании также требуют плату за передачу данных и за вычисления, в случае если ученый хочет провести хранящиеся данные через аналитическое программное обеспечение. Инструмент анализа данных Redshift от Amazon обходится в 25 центов в час, или $1 тысяча за терабайт в год.

В середине мая 2015 года американский частный исследовательский медицинский центр и компания Крейга Вентера подписали соглашение о совместном секвенировании генома для поиска генов новых заболеваний. В конце марта 10 лидирующих фармацевтических и биотехнологических компаний решили сотрудничать в области расшифровки генома 100 тысяч тяжелобольных пациентов.

Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru
08.06.2015

Читать статьи по темам:

база данных биоинформатика геномика интернет Версия для печати
Ошибка в тексте?
Выдели ее и нажми ctrl + enter
назад

Читать также:

23andMe запустит производство лекарств

Американская компания 23andMe, прославившаяся ДНК-тестами, планирует использовать свою базу генома при самостоятельной разработке лекарств от различных заболеваний.

читать

Систему менять надо!

Новые исследования, особенно в геномике, поставляют огромный объем информации, который не могут обработать современные базы данных. Поэтому необходимо задуматься о создании принципиально новой глобальной информационной системы.

читать

Облачная биоинформатика для «-омиков»

На вопросы где хранить, как хранить и как обеспечить доступ к данным, которые получает протеомика, геномика, микробиомика и прочие так называемые «-омики» позволяют ответить биоинформационные облачные технологии.

читать

«Википедия» создает интернет-генотеку

По планам создателей, основная задача Gene Wiki заключается в унификации информации по каждому гену, а также в возможности добавлять специалистами новейшую информацию по мере ее появления.

читать

Проект «100 тысяч геномов» продолжает работу

Полученные данные помогут изучить механизмы развития генетически обусловленных заболеваний и создавать эффективные методы персонализированной терапии для тысяч пациентов.

читать

К проекту Genomics England подключилась Бигфарма

Десять крупнейших фармацевтических и биотехнологических компаний договорились о сотрудничестве с британской государственной организацией Genomics England.

читать