Эпигеномика долголетия
Старение и долголетие:
эпигеном раскрывает тайны
* – Подробнее о процессах эпигенетической модификации генома – в статьях: «Развитие и эпигенетика, или история о минотавре» [1], «Эпигенетические часы: сколько лет вашему метилому?» [2], «Эпигенетика поведения: как бабушкин опыт отражается на ваших генах» [3].
* – Подробнее о РНК и связанных с ней механизмах воздействия на геном рассказано в статьях: «Обо всех РНК на свете, больших и малых» [4], «Как избавиться от РНК за несколько минут» [5], «микроРНК – чем дальше в лес, тем больше дров» [6].
* – О мобильных генетических элементах эукариот можно прочитать в статьях: «Тайны „молекулярных паразитов“, или Как путешествовать по геному» [10], «Разнообразия много не бывает: чем занимаются мобильные элементы генома в мозге» [11], «Геном человека: полезная книга, или глянцевый журнал?» [12].
* – Подробнее АФК и связанные с ними процессы рассмотрены в статьях «Активный кислород: друг или враг, или о пользе и вреде антиоксидантов» [19] и «Антиоксиданты против пиелонефрита» [20].
* – Свойства этих белков описаны в статье «Катится, катится к ДНК гистон» [32].
* – Этот процесс на примере профориентации клеток крови прекрасно проиллюстрирован (в прямом смысле) в комиксе «Кем быть? Как гемопоэтическая стволовая клетка выбирает профессию» [34]. – Ред.
* – О природе различных, не только эпигенетических, возрастных изменений в клетках и возможных путях их преодоления образно рассказывает статья «Зачем клетки стареют» [37]. – Ред.
- биомолекула: «Развитие и эпигенетика, или история о минотавре»;
- биомолекула: «Эпигенетические часы: сколько лет вашему метилому?»;
- биомолекула: «Эпигенетика поведения: как бабушкин опыт отражается на ваших генах»;
- биомолекула: «Обо всех РНК на свете, больших и малых»;
- биомолекула: «Как избавиться от РНК за несколько минут»;
- биомолекула: «микроРНК – чем дальше в лес, тем больше дров»;
- Callaway E. (2014). Epigenomics starts to make its mark. Nature. 508, 22;
- Вайсерман А.М., Войтенко В.П., Мехова Л.В. (2011). Эпигенетическая эпидемиология ассоциированных с возрастом заболеваний. Онтогенез. 42, 1–21;
- Hancks D.C. and Kazazian H.H. (2012). Active human retrotransposons: variation and disease. Curr. Opin. Genet. Dev. 22, 191–203;
- биомолекула: «Тайны „молекулярных паразитов“, или Как путешествовать по геному»;
- биомолекула: «Разнообразия много не бывает: чем занимаются мобильные элементы генома в мозге»;
- биомолекула: «Геном человека: полезная книга, или глянцевый журнал?»;
- Kucharski R., Maleszka J., Foret S., Maleszka R. (2008). Nutritional control of reproductive status in honeybees via DNA methylation. Science. 319, 1827–1830;
- Lyko F., Foret S., Kucharski R., Wolf S., Falckenhayn C., Maleszka R. (2010). The honey bee epigenomes: differential methylation of brain DNA in queens and workers. PLoS Biol. 8, e1000506;
- Corona M., Velarde R.A., Remolina S., Moran-Lauter A., Wang Y., Hughes K.A., Robinson G.E. (2007). Vitellogenin, juvenile hormone, insulin signaling, and queen honey bee longevity. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 104, 7128–7133;
- Gentilini D., Mari D., Castaldi D., Remondini D., Ogliari G., Ostan R. et al. (2013). Role of epigenetics in human aging and longevity: genome-wide DNA methylation profile in centenarians and centenarians’ offspring. Age (Dordr). 35, 1961–1973;
- Soubry A., Schildkraut J.M., Murtha A., Wang F., Huang Z., Bernal A. et al. (2013). Paternal obesity is associated with IGF2 hypomethylation in newborns: results from a Newborn Epigenetics Study (NEST) cohort. BMC Med. 11, 29;
- Cencioni C., Spallotta F., Martelli F., Valente S., Mai A., Zeiher A.M., Gaetano C. (2013). Oxidative stress and epigenetic regulation in ageing and age-related diseases. Int. J. Mol. Sci. 14, 17643–17663;
- биомолекула: «Активный кислород: друг или враг, или о пользе и вреде антиоксидантов»;
- биомолекула: «Антиоксиданты против пиелонефрита»;
- Weitzman S.A., Turk P.W., Milkowski D.H., Kozlowski K. (1994). Free radical adducts induce alterations in DNA cytosine methylation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91, 1261–1264;
- Гречанина Е.Я., Лесовой В.Н., Мясоедов В.В., Гречанина Ю.Б., Гусар В.А. (2010). Закономерная связь между развитием некоторых эпигенетических заболеваний и нарушением метилирования ДНК вследствие дефицита ферментов фолатного цикла. Ультразвуковая перинатальная диагностика. 29, 27–59;
- Zijno A., Andreoli C., Leopardi P., Marcon F., Rossi S., Caiola S. et al. (2003). Folate status, metabolic genotype, and biomarkers of genotoxicity in healthy subjects. Carcinogenesis. 24, 1097–1103;
- Kim C.S., Kim Y.R., Naqvi A., Kumar S., Hoffman T.A., Jung S.B. et al. (2011). Homocysteine promotes human endothelial cell dysfunction via site-specific epigenetic regulation of p66shc. Cardiovasc. Res. 92, 466–475;
- Галимов Е.Р. (2010). Роль p66shc в окислительном стрессе и апоптозе. Acta Naturae. 4, 49–56;
- Kim Y.R., Kim C.S., Naqvi A., Kumar A., Kumar S., Hoffman T.A., Irani K. (2012). Epigenetic upregulation of p66shc mediates low-density lipoprotein cholesterol-induced endothelial cell dysfunction. Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. 303, 189–196;
- Pani G. (2010). P66SHC and ageing: ROS and TOR? Aging (Albany NY). 2, 514–518;
- Blagosklonny M.V. (2013). MTOR-driven quasi-programmed aging as a disposable soma theory: blind watchmaker vs. intelligent designer. Cell Cycle. 12, 1842–1847;
- Ranieri S.C., Fusco S., Panieri E., Labate V., Mele M., Tesor V., Ferrara A.M. et al. (2010). Mammalian life-span determinant p66shcA mediates obesity-induced insulin resistance. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 107, 13420–13428;
- Tollefsbol T. (2014). Dietary epigenetics in cancer and aging. Cancer Treat. Res. 159, 10;
- O’Sullivan R.J., Kubicek S., Schreiber S.L., Karlseder J. (2010). Reduced histone biosynthesis and chromatin changes arising from a damage signal at telomeres. Nat. Struct. Mol. Biol. 17, 1218–1225;
- биомолекула: «Катится, катится к ДНК гистон»;
- Галицкий В.А. (2009). Эпигенетическая природа старения. Цитология. 5, 388–397;
- биомолекула: «Кем быть? Как гемопоэтическая стволовая клетка выбирает профессию»;
- Fraga M.F., Ballestar E., Paz M.F., Ropero S., Setien F., Ballestar M.L. et al. (2005). Epigenetic differences arise during the lifetime of monozygotic twins. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102, 10604–10609;
- Wang S.C., Oelze B., Schumacher A. (2008). Age-specific epigenetic drift in late-onset Alzheimer’s disease. PLoS ONE. 3, e2698;
- биомолекула: «Зачем клетки стареют»;
- Ванюшин Б.Ф. (2013). Эпигенетика сегодня и завтра. Вавиловский журнал генетики и селекции. 17, 805–832.