Полный эпигеном
Американские ученые расшифровали эпигеном человека
Медновости
Американским ученым удалось расшифровать эпигеном клеток человека, сообщает Science Daily (What Drives Our Genes? Researchers Map The First Complete Human Epigenome).
Исследование провела группа сотрудников Лаборатории геномного анализа в Институте биологических исследований Солка (Salk Institute for Biological Studies) под руководством директора лаборатории, профессора Джозефа Экера (Joseph Ecker). Отчет об их работе опубликован в журнале Nature.
Активность генов определяется не только их последовательностью в молекуле ДНК, но и другими факторами, например, пространственной конфигурацией двойной спирали и ее метилированием. Термином «эпигеном» принято обозначать все факторы, определяющие, какие из генов, составляющих геном, работают, а какие – отключены.
Сотрудники Лаборатории геномного анализа сосредоточились на изучении метилирования ДНК. Один из авторов исследования Райан Листер (Ryan Lister) разработал эффективный метод, позволяющий не только обнаружить метильные группы в составе молекулы ДНК, но и составить схему их расположения в изучаемом геноме.
Исследователи расшифровали эпигеном эмбриональных стволовых клеток человека и клеток соединительной ткани легких (фибробластов). Выяснилось, что в геноме фибробластов большинство метильных радикалов располагалось рядом с цитозином. В ДНК стволовых клеток около 25 процентов метилирования происходило рядом с другими элементами двойной спирали.
Для подтверждения своих открытий исследователи сравнили эпигеномы эмбриональных стволовых клеток и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, полученных из фибробластов. Процент метильных радикалов, располагавшихся не у цитозина, совпадал в обеих группах клеток.
На следующем этапе исследований группа Экера планирует изучить влияние эпигенетической структуры ДНК на развитие клеток, а также формирование ряда заболеваний. Кроме того, ученые хотят оценить изменения эпигенома в процессе старения, а также под воздействием факторов окружающей среды.
Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru
16.10.2009