Российский браузер для укрепления иммунитета
Ученые из Института биоорганической химии РАН разработали многофункциональный браузер VDJviz для работы с большими объемами данных, получаемых с помощью современных средств анализа последовательностей ДНК. Разработка позволит ускорить развитие иммуногеномики. Статья о результатах работы опубликована на английском языке в журнале BMC Genomics (Bagaev et al., VDJviz: a versatile browser for immunogenomics data).
По словам одного из авторов статьи Ивана Звягина, программа получила свое название – VDJviz – от названия групп фрагментов генома, из которых формируются зрелые гены рецепторов В- и Т-клеток иммунной системы, а также антител: V – variable, D – diversity и J – joining.
«Сложный процесс созревания таких генов, называемый V(D)J-рекомбинация, лежит в основе формирования адаптивного иммунитета – защитной системы организма, теоретически способной противостоять любому встречаемому патогену и предотвращать развитие опухолей», – сказал ученый.
Современные методы молекулярной биологии позволяют определять кодирующие последовательности этих гипервариабельных рецепторов и иммуноглобулинов. Обработка таких данных с помощью различных инструментов биоинформатики помогает исследователям восстанавливать репертуары клеток системы адаптивного иммунитета. VDJviz помогает эффективно решать эту задачу – программа не требует специальных навыков программирования и доступна любому биологу.
По словам г-на Звягина, проект поможет в разработке «новых методов терапии болезней аутоиммунного и онкологического характера, а также аллергий».
Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru
04.10.2016