Считаем нуклеиновые кислоты с точностью до молекулы

Предложен новый метод подсчета ДНК
Александр Сотов, «Российская газета» 

Биологи из Университета Хельсинки (Финляндия) и Каролинского института (Швеция) предложили новый эмпирический метод оценки числа молекул ДНК и РНК, который способен увеличить точность современных технологий чтения и копирования переносчиков генетической информации (Karolinska Institutet, A better way to count molecules discovered – ВМ).

В опубликованной в журнале Nature Methods статье (Kivioja et al., Counting absolute numbers of molecules using unique molecular identifiers) предлагается метод подсчета абсолютного числа молекул в пробе, который не требует ни идентификации каждой отдельной молекулы, ни учета произведенных от них копий. Достигается это за счет того, что анализируемая молекула сначала делается уникальной. Используется для этого особая метка. Ею может служить случайно составленный фрагмент ДНК, которые ученые присоединяют к обрывкам анализируемой цепочки, или произвольный участок в каждом сегменте молекулы после разбивки ее на короткие цепочки нуклеотидов.

Подсчет числа биологических молекул является важнейшей задачей при оценке клеточного ответа, что необходимо при многих клинических измерениях. Существует большое число аналитических методов оценки относительного числа ДНК путем анализа выборки, однако в клинической практике единственным доступным методом оценки абсолютного числа молекул остается метод цифровой полимеразной цепной реакции (цифровая ПЦР), который лимитирован тем, что при каждом анализе исследуется одна специфическая молекула. Новый метод призван снять эти ограничения, так как «может быть использован для оценки числа молекул, не наблюдая за каждой из них в отдельности», отмечают авторы статьи.

Портал «Вечная молодость» http://vechnayamolodost.ru
22.11.2011